در نبرد Sekigahara در سال 1600 ، Ieyasu وفاداران Hideyori و دیگر رقبای غربی را شکست داد. از این رو ، او تقریباً به قدرت و ثروت نامحدودی دست یافت. در سال 1603 ، ایایاسو توسط امپراطور Shogun منصوب شد و دولت خود را در ادو ( توکیو ) تأسیس کرد . شوگان های توکوگاوا برای 250 سال قابل توجه حاکم بر ژاپن بودند.

ایایاسو کل کشور را تحت کنترل خود گرفت. او با زیرکی هوشمندانه زمین های به دست آمده را در بین daimyo توزیع کرد: واسط های وفادارتر (کسانی که پیش از Sekigahara از او حمایت می کردند) بر این اساس دامنه های مهمتری از نظر استراتژیک دریافت می کردند. همچنین daimyo موظف بودند هر سال دوم را در Edo بگذراند. این به معنای یک بار مالی بزرگ برای daimyo بود و قدرت وی را در خانه تعدیل می کرد.

ایایاسو به ترویج تجارت خارجی ادامه داد. او با انگلیسی و هلندی روابط برقرار کرد. از سوی دیگر ، وی سرکوب و آزار و اذیت مسیحیت را از سال 1614 به بعد عملی کرد.

پس از تخریب قبیله Toyotomi در سال 1615 هنگامی که ایایاسو قلعه اوساکا را به تصرف خود درآورد ، او و جانشینان وی عملا دیگر هیچ رقیبی نداشتند و صلح در کل دوره ادو پیروز شد. بنابراین ، رزمندگان ( سامورایی ) نه تنها در هنرهای رزمی بلکه در ادبیات ، فلسفه و هنرها ، به عنوان مثال مراسم چای ، خود را آموزش می دادند .

در سال 1633 ، shogun Iemitsu سفر به خارج از کشور را منع کرد و تقریباً در سال 1639 ژاپن را کاملاً منزوی کرد و با کاهش مخاطبین به خارج از کشور ، برای تنظیم روابط تجاری با چین و هلند در بندر ناگازاکی به شدت تنظیم کرد . علاوه بر این ، تمام کتاب های خارجی ممنوع اعلام شد. daimyo منتخب همچنین اجازه داد تا با کره ، پادشاهی ریوکیو و عینو در هوکایدو تجارت کند .

با وجود انزوا ، تجارت داخلی و تولید محصولات کشاورزی همچنان در حال پیشرفت است. در دوره ادو و به ویژه در دوره ژنووكو (1703 – 1688) فرهنگ عامه شکوفا شد. اشکال جدید هنری مانند kabuki و ukiyo-e مخصوصاً در بین اهالی شهر بسیار رایج شد.

بیشترین فلسفه مهم توکوگاوا ژاپن نو بود آیین کنفوسیوس ، با تاکید بر اهمیت اخلاق، آموزش و پرورش و نظام سلسله مراتبی در دولت و جامعه: یک چهار نظام طبقاتی سخت در طول دوره ادو وجود داشت: در بالای سلسله مراتب اجتماعی ایستاده بود سامورایی ، به دنبال دهقانان ، صنعتگران و بازرگانان. اعضای چهار طبقه مجاز به تغییر وضعیت اجتماعی خود نبودند. فراموشی ها ، افراد دارای حرفه هایی که نجس تلقی می شدند ، کلاس پنجم را تشکیل می دادند.

در سال 1720 ممنوعیت ادبیات غربی لغو شد و چندین آموزش جدید از چین و اروپا وارد ژاپن شد (آموزش هلندی). مکاتب جدید ناسیونالیستی که عناصر شینتو و کنفوسیونیست را با یکدیگر ترکیب می کردند نیز توسعه یافت.

حتی اگر دولت توکوگاوا طی چند قرن کاملاً پایدار باقی بماند ، موقعیت آن به دلایل مختلف به طور پیوسته رو به زوال است: وخیم تر شدن اوضاع مالی دولت منجر به افزایش مالیات و آشفتگی در بین جمعیت مزرعه شد. علاوه بر این ، ژاپن مرتباً بلایای طبیعی و سالهای قحطی را تجربه می کرد که باعث بروز شورش ها و مشکلات مالی بیشتر برای دولت مرکزی و دایمیو می شد. سلسله مراتب اجتماعی از هم پاشید که طبقه بازرگان به طور فزاینده ای قدرت یافت و در حالی که برخی سامورایی از نظر اقتصادی به آنها وابسته شدند. در نیمه دوم دوره ، فساد ، بی کفایتی و افول اخلاق در دولت باعث مشکلات بعدی شد.

در اواخر قرن 18th ، فشارهای خارجی مسئله ای فزاینده و مهم شد ، هنگامی که روس ها برای اولین بار سعی کردند بدون موفقیت موفق به برقراری تماس های تجاری با ژاپن شوند. آنها در قرن نوزدهم توسط ملل دیگر اروپایی و آمریکایی ها دنبال شدند. سرانجام كودودور پری در سال 1853 و مجدداً در سال 1854 بود كه دولت توكوگووا را وادار كرد تا تعداد محدودی بنادر را برای تجارت بین الملل باز كند. با این حال ، تا زمان ترمیم میجی در سال 1868 ، تجارت بسیار محدود ماند .

همه عواملی که در کنار هم قرار گرفته اند ، احساسات ضددولتی رو به رشد بوده و باعث حرکات دیگری همچون تقاضای بازگرداندن قدرت امپریالیستی و احساسات ضد غربی ، به ویژه در میان سامورایی های فوق محافظه کار در حوزه های مستقل عمل مانند Choshu و Satsuma می شود. با این حال ، بسیاری از مردم ، به زودی مزایای بزرگ ملل غربی را در علم و نظامی به رسمیت شناختند و طرفداری از گشودگی کامل برای جهان داشتند. سرانجام ، محافظه کاران نیز پس از مواجهه با کشتی های جنگی غربی در چندین حادثه ، این واقعیت را به رسمیت شناختند.

در سال 1867-68 ، دولت توکوگاوا به دلیل فشارهای سنگین سیاسی سقوط کرد و قدرت امپراتور میجی دوباره برقرار شد .